رئیس اداره وزارت امور خارجه کشورمان در این جلسه، ضمن تقبیح این اقدام خلاف عرف دیپلماتیک، مراتب اعتراض شدید جمهوری اسلامی ایران را در این خصوص اعلام داشت. وی تاکید کرد: فارغ از بدیهی بودن ضرورت احترام میهمان به نمادهای کشور میزبان، ادای احترام به سرود ملی کشورها، یک رفتار شناخته شده بین‌المللی است، مضافا اینکه اقدام نماینده اعزامی افغانستان تناسبی با اهداف عالی مشارکت در کنفرانس وحدت اسلامی ندارد. سرپرست سفارت افغانستان ضمن تاکید بر احترام ویژه کشورش برای جمهوری اسلامی ایران اظهار داشت: اقدام یادشده، عملی شخصی بوده و به هیچ وجه منعکس کننده نظر کشور متبوعش نیست. وی افزود: مراتب را سریعا به کابل منعکس خواهد کرد. سی و هشتمین کنفرانس بین المللی وحدت اسلامی با حضور ۱۴۴ تن از علما و فرهیختگان خارجی از ۳۶ کشور در قالب ۹ وبینار پنجشنبه - ۲۹ شهریورماه - با حضور رئیس جمهور در سالن اجلاس سران آغاز شد و مسعود پزشکیان در نخستین نشست این کنفرانس سخنرانی کرد. نماینده طالبان در تهران که در کنفرانس وحدت اسلامی در تهران  شرکت کرده بود زمان پخش سرود ملی ایران از جای خود برنخواست که این اقدام واکنش های زیادی را به همراه داشت ، در این راستا کاظمی قمی نماینده ویژه دولت در امور افغانستان در واکنش به بی احترامی «عزیزالرحمان منصور» معاون «تنظیم امور عرفان و اماکن دینی» وزارت ارشاد، حج و اوقاف طالبان به سرود ملی ایران نوشته بود: «عدم احترام به اصول دیپلماتیک به بهانه ممنوعیت نواختن موسیقی از مبادی شریعت معنا و مصداقی ندارد، چرا که اگر اینگونه باشد، استماع را نیز شامل می‌شود.» مقام دینی افغانستانی شرکت کننده در کنفرانس وحدت اسلامی نیز امروز - ۳۰ شهریورماه - انتشار پیامی تصویری، بر احترام کامل به جمهوری اسلامی ایران و اهمیت روابط دوجانبه تاکید کرد و ضمن عذرخواهی بابت سوءتفاهم ایجاد شده گفت به هیچ وجه قصد بی احترامی نداشته است. وی همچنین علت این کار را مرسوم نبودن در کشور خودشان اعلام کرد و گفت: وقتی در کشور ما سرود برای وطن خوانده می شود همه در حالت نشسته هستند و ما به عرف و سنت خودمان عمل کردیم.