به گزارش گروه سیاسی عصر قانون حجت الاسلام ابراهیم رئیسی در پیامی برای کنگره ملی آیت الله کوهستانی آورده است: آیت الله آقای شیخ محمد کوهستانی بی شک در زمره عالمان وارسته بود که با وجود محدودیت‌های نظام شاهنشاهی با توکل به خدا و ایثار خدمات ماندگاری در راستای ترویج معارف الهی و تربیت شاگردان برای تحکیم مکتب اسلام به یادگار گذارد. در ادامه این پیام آمده است: تجلیل از عالمان و اندیشمندان بزرگ دینی که با اخلاص و روحیه جهادی عمر گرانمایه خود را در راه نشر معارف نورانی قرآن و اهل بیت و زنده نگه داشتن ارزش‌های الهی و انسانی و تربیت انسان‌ها صرف می‌کنند، حرکتی پسندیده و موجب اشاعه فضیلت‌ها در جامعه است. همچنین تصریح شده است: این عالم‌پارسا با تأسیس حوزه علمیه در ملک شخصی در روستای کوهستان بهشهر، در انتقال دانش به طلاب تلاش کرد که این حرکت باقیات صالحات و صدقه جاریه برای ایشان است. حجت الاسلام رئیسی یادآور شد: آیت الله کوهستانی مرد علم و عمل و اخلاق بود و با وجود تمکن مالی، ساده زیست و مردمی و کمالات معنوی و کرامات بود و دعای همیشه این فقیه وارسته ماندن در خط اسلام بود و تا پایان عمر بر این مسیر استوار بود. وی گفت: گرامیداشت یاد آن عالم وارسته به عنوان الگوی اخلاص عمل و پراکنده کردن رایحه اسلام برای جامعه الهام بخش بود و باید با حراست به آیندگان منتقل شود.